文部科学省の調査ではいじめや教員との関係に問題があったと言う生徒がずいぶん少ないのに、NHK調査ではかなり割合が高いですね。
どちらが本当の数字なのか、想像できますね。→

不登校は「家庭が原因」?教員と生徒で食い違い –
https://toyokeizai.net/articles/-/283662